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娜塔莉farny at desk.

娜塔莉farny

多少个细胞样品中?

学生是国际队的一部分,介绍新的方式在液体菌种的估计数

2020年10月26日
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一个im体育app平台下载研究员和学生的团队是一群在世界各地244个实验室是表现在生物学,估计液体样品中细菌的数量解决长期存在的问题的一部分。

娜塔莉farny,生物学和生物技术,七现任和前任im体育app平台下载大学生助理教授参加了2018年的研究,其结论估计的微小密度的最好方式 即大肠杆菌 在液体培养物的细菌是通过稀释二氧化硅微球的已知量在培养,通过它的光辉光,并使光密度的计算。

“的假设是,如果我们能找到的光密度测量校准好,很多实验室可能来自同一单位同一实验报告结果,并得到同样的结果,” farny说。 “我们发现,结果准确,重复性好。”

研究结果发表 在九月号 通信生物学。

这项研究是部分 国际基因工程机器大赛(IGEM) 每年一度的盛事,其中高中,在世界各地利用分子生物学技术本科生和研究生来设计,构建和测试解决方案,以解决国际问题。

im体育app平台下载的团队成员贝克阿鲁达,梅浩,卡米尔·皮尔斯,亚历克斯Rebello的,ARTH夏尔马,凯莉·萨姆纳,和贝利甜蜜。他们参与研究之上的 主体工程,其中涉及该测试可应用于多叶作物如莴苣蛋白以停止生长 即大肠杆菌 细菌和减少食源性疾病的比率。

farny劝im体育app平台下载学生是IGEM基础测量委员会,设计了细菌的测量研究的联合主席。

作为一个国际研究的一部分,我们深知我们的数据将要被使用的东西,将有助于未来的研究简直太酷了,我真的很高兴我在一纸合着我甚至毕业前。
- 凯莉萨姆纳
类2021

研究集中在既小又重要的一个问题。细菌测量只有1微米对面,非常小,大多数实验室缺乏文书样本中的每一个细胞计数。相反,研究人员使用该测量吸光度或光透射分光光度计通过样品计算的光密度。

挑战,farny说,是计算光学密度的方式不测量确切细胞计数,并且结果是相对于执行测量仪器。表示用于合成生物学,其目的是与工程标准的测量和可重复的结果生物工艺领域中的问题。

在IGEM研究分布式相同的材料,以244个学生团队,并要求他们进行具体的实验测试三种不同的方法。在结束时,小组发现,测量的已知浓度的1微米二氧化硅球体的光密度允许实验室产生的数量的更精确的光密度计算 即大肠杆菌 细胞存在于样品中,farny说。与微球的已知量校正的光密度也使得能够比较不同类型的实验室设备的结果。

萨姆纳,从迦南,新罕布什尔州,是谁在生物化学与生物和生物未成年专业四年级学生,说im体育app平台下载学生团队花了两个星期的测量研究。

“作为一个国际研究的一部分,我们深知我们的数据将要被使用的东西,将有助于未来的研究是真的很酷,”萨姆纳说。 “我真的很高兴我在一纸之前,我甚至毕业的合着者。”

farny说,经研究确定的测量方法是快速,廉价,且易于实现。不过,目前还不清楚,如果研究人员将采用它。

“搞清楚,接下来的事情就是如何激励研究人员通过一项协议,可以使他们的研究更具有可重复性,因此它可以被应用,” farny说。 “我们还需要方法来校准其它生物学测量。仍然有很多的挑战。”

- 丽莎eckelbecker

 

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